Yuwen's profile白日黑夜,年年月月PhotosBlogListsMore Tools Help

Blog


    10/14/2008

    处女鲨鱼产仔得到证明

     
    一度有人发文说观察到鲨鱼无性生殖,但是普遍被认为是精子被储存在母鲨鱼体内,但是现在DNA Fingerprinting证明了有条这样产生的鲨鱼确实没有父系DNA。
    在每个人都觉得应该已经被了解的很清楚的研究方向里,居然能有这么震惊的结果,真是难以置信。
    这在鲨鱼的世界里面不是真龙天子就是圣子了吧。
     
    不过发现自己孤陋了,原来脊椎动物无性生殖被观察到已经好多次了,只是非常罕见而已:
     
    ps,最近生活平淡到,吃到很甜的葡萄就会觉得很爽,不过今天买的葡萄似乎是过于甜了都没葡萄味了,需要喝水冲淡才不觉得那么hou,夸张。
    8/4/2008

    世界小还是网络小?

    微软分析了2006年6月所有msn对话,结论是任何两个用户可以通过平均6.6步联系起来,号称是第一次对那个著名的小世界理论的直接验证
     
    不过我觉得有一点问题就是,比起真实世界,网络,尤其msn这种即时通讯软件,应该是个更小的世界
    比如我msn上就有很多国家的人但是其实都没见过
    所以感觉这个好像不是怎么能算数
     
    另外,历史上有人尝试着让参与实验的人写信给一个选定的目标,结果只有远不到一半的信辗转能到这个人手中
    当然,这个也有点问题就是每个人很难知道自己连向那个人的最佳途径,以为寄出去可以转到的反而不一定能
     
    不管怎么样,微软的想法还是很不错的,而且msn的1.8亿用户群也不是个小数字
    期待更多结果来看网上做出的东西到底可靠不可靠
    5/4/2008

    辨材须待十年期

    Science的新文章,粗体那句太牛了:
    Fire is a global driver of carbon storage and converts a substantial proportion of plant biomass to black carbon (for example, charcoal), which remains in the soil for thousands of years. Black carbon is therefore often proposed as an important long-term sink of soil carbon. We ran a 10-year experiment in each of three boreal forest stands to show that fire-derived charcoal promotes loss of forest humus and that this is associated with enhancement of microbial activity by charcoal. This result shows that charcoal-induced losses of belowground carbon in forests can partially offset the benefits of charcoal as a long-term carbon sink.
     
    大家快想想有什么好的idea然后去后院刨个坑埋下去,十年后说不定可以长成science。不过得常常祈祷别在第九年让别人发了。。。

    这是鲁棒的分割线,以下为无关内容

    晚上整理了大约有几个月没看的垃圾信件,碎纸就装了慢慢一垃圾袋。按理每天睡觉前读完当天的信,然后该处理的处理一下一点都不费时间的,既不会错过信息也不会看到垃圾纸张在桌上堆积。可是悲哀的发现,不知道从什么时候开始,每天定时的做某件事情已经成为不可能,除了硬性要求的上课之外。
     
    这也是一点让我怀念中学的地方:事情和时间都是别人安排好的,日子过得井井有条,每周、每天,甚至每个小时都在完成该完成的事情。当然那时候也不喜欢那么忙碌的生活,盼望着自由。但是现在多么希望在后来逐渐享受自由的时候能多保留一些那种健康的节律。
    4/1/2008

    懂概率的孩子

    刚才在nature news上看到的,一岁以内的婴儿就有相当的根据概率做出预测的能力,第一次让人们认识到婴儿在这种需要点思维或者直觉的方面也有不错的造诣。
    比如,让他守门,进去了九十个非美女和十个美女,然后五个五个成堆走出,当某次出来的五个都是美女的时候婴儿会非常好奇看个不停。
     
    当然我这个例子有明显漏洞。。也可能说明婴儿很小就有审美观,原来paper的例子很数学:
     
    比较好玩的是里面的一句话:How come we start so well and we end up so poorly? 颇有点“小时了了,大未必佳”的意思。
    不知道这种能力是生下来之后慢慢成长起来的还是生下来之前就有呢?不管怎么,大脑真是太神奇了,要么这么强大的能力都能遗传,要么这么强大的能力都可以白手起家学到。想来在信息膨胀的时代人类的学习能力也是空前提高了的,古代人花十几年才能明白的东西现在小学几年就教完了,难道在遥远的未来小学毕业生就可以轻松掌握微分方程和数电模电?太可怕了
     
    顺便想起来几周前看到有人发明了一种绑在腿上就可以发电的装置,可以供给mp3或者手机足够的电力,没想到这玩意也能发science,虽然很有意思。他们的亮点是这个装置不会额外消耗多少能量。不过,生物能本来就很环保了,哪怕多吃点也没事。
    或许如果替代能源开发不出来的话,等石油开采光了说不定大家就坐马车,划船,训练老鼠来摇风扇,跑三千米给手机充电了。
     
    为什么总觉得别人的科研这么有趣呢?难道真如我的某个签名档所说,这玩意就像porn,结果起来总是美妙动人的,制作的过程却是一遍遍无聊的重复。。。
    3/6/2008

    数数也能发paper

     
                法国一个组数了一种植物产生两种种子的概率,发现在市内重的种子明显多。为什么呢?因为重的种子更有可能占据脚下来之不易的土壤,而在郊外就没这个问题。于是他们在模拟街道和野外的环境下种了同样的植物实验,发现重种子概率分别是 15% 和 10%. 而市内自然条件下重种子概率是 50% 之多。
                于是算了一下,完成这个自然选择的过程需要12代。而那条街道差不多修了正好12年。。。证明进化可以如此神速。
                一直觉得孟德尔成天种豌豆数果实的精神实在是非常的科研,没想到百年后数数还是能发paper。 好的idea果然到处都有,只是我太笨了,哎。
                有诗曰:小强固禀异,青草也无敌。修炼十二载,长遍法兰西。
     
                 reference:
    9/27/2007

    走近民科

    读IEEE transactions on biomedical engineering, 偶遇一篇很强的文章:
    YinYang Dynamic Neurobiological Modeling and Diagnostic Analysis of Major Depressive and Bipolar Disorders
    IEEE TRANSACTIONS ON BIOMEDICAL ENGINEERING, VOL. 54, NO. 10, OCTOBER 2007
     
         从摘要和背景里面抄几句翻译一下:
     
         本研究的创新性和意义在于: 把阴阳引入了生物医学, 以理解一些神经系统的疾病, 并提出一个新的标准模型用于诊断, 治疗和制药研究及应用;  提出了情绪调节的数学基础...
     
         根据阴阳理论, 任何事物都有阴阳两面. 阴是负面属性, 阳是正的属性. 两面的和谐共存被认为是生物的身心健康的关键条件...
     
         因为平衡是热力学的核心事实, 它(阴阳理论)可以被认为是一种对自然科学和社会科学都至关重要的极性化的整体事实...
     
         贝叶斯阴阳和布尔阴阳大体上和经典认知理论相符, 而xxx从一个更基础的层面上对阴阳进行了研究...提出了阴阳双极化逻辑和集合论以理解信息融合, 可视化, 决策, 合作和全面调控...
     
         基于双极化阴阳理论, 主要的抑郁症和躁郁症都可以理解为生物的和情绪的失衡或者平衡两极和谐的丢失...
     
         然后提出了一个所谓的阴阳两极化集合..定义了一堆运算...看着晕,直接跳过...
     
         最后结论,有句话直接照抄摘要,并说鉴于实际应用只能留给以后的研究, 本文中的例子只是阐述一下基本想法...
     
         彻底震撼了, 有人要是把这种空头来空头去的模型投给生物医学杂志, 还不马上被拍死, 投给中医杂志估计也会让编辑们云里雾里的....可是居然发在BME的杂志上了.
     
         另, 这哥们以所谓的阴阳两极化模型为题, 还颇发了几篇文章, 平时总觉得自己搞得东西有点忽悠, 因为虽然模型是真的但是算出来的那些结果到底和实际情形到底有多大关系就谁也不知道了, 现在看来做人还是要敢忽悠啊....
     
         又, 在我诚恳建议数学家维给八卦建个数学模型, 然后发篇文章叫<<普世性八卦动态模型和时间万物命运的预测>>之后, 维总欣然表示要敢想敢作, 建立一个包含中国所有传统文化的模型并投给民科通讯. 听到这里, 我豁然开朗, 不知道办杂志容易不, 要容易的话, 以后办个杂志, 专门用于收录民科文章, 发表各种标新立异高瞻远瞩惊世骇俗的研究, 全球发行. 根据投稿人出名欲望高低审稿, 拍卖篇幅以收取高额版面费....
    8/26/2007

    钻石

    acore突然问我钻石为啥闪闪发光,我说,折射率吧,查了下,果然:
    钻石本身不闪闪发光,卖的都那么漂亮是因为加工过,当然,能加工那么漂亮也和折射率高有关
     
    然后acore接着扯, 说钻石矿都是成堆的,所以,探测钻石矿的最好办法之一就是引力梯度 (不禁yy一下,要是我能挖出一筐钻石...-.-)
    因此干他们这行的土鳖们最大的梦想就是探测到一个钻石矿,据说半年身价就会上亿
    然后得意的说,知道我们把测引力的仪器放在卡车上的原因了吧. (ps前几天第一次听说物理系实验室有一辆卡车的)
    旋即又沮丧的承认, 可惜到现在, 还没有土鳖能成功探测到的...所以,只能忽悠钻石公司骗经费..
     
    为了考证这个,尤其是那个,成堆钻石的存在性.....我就开始无聊..去看wiki...
     
    1.me:钻石的导热性非常好,超过金银
       acore:这个有啥利用价值么?
       me:这个...做核电站冷却剂?...
     
    2.钻石的燃点只有800度,是普通的烧煤的炉子就能达到的温度, 而金银的熔点都上千
       acore: 烧了就变二氧化碳了??太可怕了. 灰都没有...
       me: 不过考虑到1, 而且金银也很导热, 所以要烧着也不容易, 当然, 想把结婚戒指扔进火炉去试的, 后果自负...:D
     
    3. acore: 就是不知道钻石有什么好的!
        me: 是啊, 太无聊了!
        acore:对,太无聊了!
        me:好像我们也很无聊...
    8/17/2007

    科研是与非(x)

     
    老板对于学生,就像#$%#对于女人
    一周没有,轻松愉快
    一个月不见,就会忐忑... 
     
    实验室的电脑就像热恋中的承诺
    貌似至关重要
    其实只是让过程多点乐趣...
    7/26/2007

    大牛是怎么决定去不去实验室的

    摘自刚才和某大牛的对话:

     Kisstar: 到实验室了
     Kisstar: 发现这里还是没人
     Kisstar: 和家里一样
     xxx: 我靠
     Kisstar: 是啊,我靠
     xxx: 我也没去实验室
     xxx: 在家里控制仪器
     Kisstar: .........你nb
     xxx: nb什么
     xxx: 我通过监控录像看到
     xxx: 实验室没人
     xxx: 那我去干什么。。
     xxx: 反正都能控制。。

    原来听说过学生做的很牛的,今天又见识了一类牛
    联想到那几个开发除了360控制云台移动的程序后被老板用来监控实验室的学生, 天上地下啊......
    5/17/2007

    诶,科研有时候就像是

     
    说是可以用弹弓打飞机
    其实是做个好打的飞机模型,然后把它打下来
    号称有打下飞机的潜力
     
    所以,对我这样的,课题成败的关键在于模型是否逼真并且好打
    小牛们可以搞出很牛的弹弓
    而设计高射炮或者导弹,那是大牛们的事情
    11/17/2006

    如此Cell

     
    好久不去水木的lifescience版了
    一去就看到一篇彪悍的文章,收集了一堆bbs文章转载,说新发的一篇nature里面图片明显ps出来的
    按照时间推断应该是底下这哥们第一次发现的
     
    大家可以看看右边那张图-40~-90的区域,中间那一堆带....
     
    不知道这是业内普遍做法还是胆大妄为的个例
    但是算我第一次目击明显伪造的数据
    而且还是cell...
     
    每次读paper想到里面每一个图都凝结了无数学生在实验台前夜以继日的劳动就觉得辛苦
    尤其想到自己做过的唯一一个课题半年就搞出个western blot
    现在看来也可能只是体现了photoshop水平而已
    对我来说反正过程结论都没什么值得关心,好像区别不大
    不知道认真读paper和很辛苦才作出一个图的同学怎么想?
     
    btw,突然发现blog点击量已经一万多了,感谢大家前来潜水灌水...
     
    发信人: yuuli (听,...听), 信区: Biology
    标  题: 在Cell上见到了最无耻的伪造了。
    发信站: BBS 未名空间站 (Thu Nov 16 23:23:06 2006), 转信
    9/7/2006

    全神贯注干了两小时的活

     
    突然发现
    好久没这么专注工作过了,blush
    又发现
    饿了....吃饭去!
    看见程序得到想要的运行结果真是目前人世间最大的享受之一阿!
     
    btw今晚orientation的时候听说有学生偷了TA的钱包然后拿信用卡去刷
    结果被人家发现一个白人刷的卡是一个典型中国人的名字而被捕
    我不担忧这个事情折射出来的人品问题
    但是深刻担忧折射出来的智商问题....
     
    8/26/2006

    死而复生

     
    本来今天早晨要去长岛的
    昨晚和spark yc icy chitty联系好了之后
    就想提前干完活,发给老板
    然后悲惨命运就此开始
    改了两行之后随手save
    提示xxx.cpp cannot be saved..
    我想反正还没改啥,就关了重新打开
    结果..
    结果...
    结果那个.cpp就消失了
    还是最重要的一个cpp,最新的备份也有一个月了...(其间在外面玩了两周)
     
    down了个easyrecovery,扫了两小时还没扫完
    困了,加上感冒,头痛的要死
    外面又风雨大作,怀着无比郁闷的心情去睡觉了,同时期待早晨能扫出来
    并且把闹钟上到了早晨6点多
    打算起来去坐火车
     
    可能前一天晚上搞得太晚
    根本就没听见闹钟响...一直睡到了10点接到spark和icy的电话
    无言以对,都不好意思说我还在睡觉..
     
    清醒了一下之后
    马上去看扫描结果
    很失望的发现恢复出来一堆鸡零狗碎的文件就是没有我想要的那个
     
    查了下train schedule,这时候再过去就2点了,而且想到老板马上要回来,无以交差
    就决定去lab弄个备份回来重写,一切从头开始,长岛也去不成了...
    贼心不死的又google了一番,发现可以试试winhex直接查特征语句
    就down了一个然后开始扫描
    速度那叫一个慢啊,而且扫描的时候别的程序慢的无法运行
    又困了,又在凄风苦雨声中睡去...
     
    醒来的时候已经下午...发现扫描出现错误,需要ignore,停顿在64%
    都有点绝望想放弃,但是发现似乎变快了,就忍了
     
    这时候奇迹出现了...在一个晚上的折腾之后终于找到了!
    没有授权不能直接copy文件
    费了点工夫选中了那些文字所在的block
    复制粘贴,终于搞定
     
    就这样搞了一天,错过了去长岛然后回到了昨天晚上的状态
    不过欣慰的是不用以后几天里面不用重写已经写过的代码了
    比起这个,那个是大折磨了...
    7/17/2006

    Graduation Day

     
    新曲推荐,hehe
    mtv做的很有煽动力,充满了年轻人的激情和勇敢,可惜我的毕业不是这样的...
     
    另外,发现nature 93年有篇article证实了起因众说纷纭的通古斯大爆炸其实就是小行星爆炸
    多么有意思的课题啊! ref: Nature 361 (1993) :40-44
     
     
    5/19/2006

    be an EE guy..

     
    下午和带我的senior聊了好久
    他建议我下学期选digital signal processing和VLSI design两门课
    有的学了
    ps原来他也是希腊人,和老板一样,不过好像从小来到这边,所以说话听不出来
     
    十天前在office depot买了canonA610,昨天还没收到,查status,说short shipped
    不解,google这个词什么意思,有人说是staples耍赖的办法,相当于cancel order
    今天打电话问客服,果然,我靠,打倒流氓店
    还整天在cnn广告说office depot takes care of you
    不过恰好赶上dell a700的deal,也罢
    可怜我居然不小心搞错expiration date
    跟银行和dell的客服又讨论了好久
    希望一周内能收到
    我靠,这就是网上买东西的效率
    十天哪,十天一管ecoli可以繁殖几十代了我tm一小相机没拿到
     
    另外,路考过了,不错,今天不知道哪里来的状态,比我以前任何一次开的都稳
    最后考完的时候知道自己pass,信心大涨,自己开车过去找教练,被考官说了,哈哈
    他说:you must get your license first to drive alone...
    5/5/2006

    大牛paper都发在什么地方的

     
    一篇讲牛paper分布的文章
    45-88年top300的paper只有13篇在nature上,43篇在jbc
    top100的是17jbc,6pnas,5nature
    大约可以理解acore为啥说nature science后来已经堕落了..
    4/27/2006

    男性更好色的理由

    刚才刷牙的时候想到的
    不知道是不是old
     
    姑且假设好色的男女的共同特性就是
    沉迷于xx,或者满脑子的xx
    学术的说,就是通过有性生殖的方式让自己细胞内的遗传信息得以承递
    当然现在这个不全等了,但是以前差不多就是这个样子的
    这样的结果,就是好色的人同等条件下获得的交配机会多,更容易产生后代
    在没有太多道德约束的情况下更是如此
     
    这样就形成了优势基因
    当然也可能不是基因决定,但是所谓见仁者仁,见淫者淫,差不多也跟遗传效果一样了
     
    男性与女性的区别在于,女性一生只有大约480次怀孕机会,而且怀孕之后就进入绝对不应期
    而男性的绝对不应期基本可以忽略,造成异性怀孕的机会基本无可限量
    所以男性的好色更容易遗传下来
    经过动物祖先,丛林时代和封建时代的无数年筛选
    就形成了现在的格局
     
    当然,道德的产生使得男性必须有所收敛
    所以道德对纵欲的打击,不是一时一次,而是影响深远
    避孕技术的产生就更是彻底颠覆了这种规律
    所以说不定在百年万年之后,可能男性和女性对性的追求境界无二,天下从此大同
    这样我终于理解了某人选避孕技术为人类历史上最伟大发明的高瞻远瞩和学术之心。。。
    4/25/2006

    检索NCBI,居然看到这么一条记录

    Time. 1998 Nov 16;152(20):96-7.
     
    The biological mother lode.

    Lemonick MD.

    PMID: 10187094 [PubMed - indexed for MEDLINE]

     

    觉得好玩,查了一下time的所有publication,发现ncbi居然收录了1486篇,看来又是我孤陋了

    以后读time的时候更加有成就感了哈,好歹也是半个学术刊物

    不知道这个有影响因子没,哈哈

    4/19/2006

    最伟大的发明

     
    高中看一个讲大爆炸的科普片,说有史以来最重要的发明是望远镜
    为什么呢
    因为望远镜的发明让人们观测到了更多的天文数据
    所以发现了行星运动的规律
    在此基础上人们建立了经典的力学体系
    因此产生了机械工业引领的现代社会
     
    很好玩
    不过为啥追溯到望远镜就停了呢?
    其实没有透镜就没法造望远镜是吧
    没有玻璃就更没法造透镜
    没有火也就没法做出玻璃啦
    所以,有史以来最伟大的发明还是取火...
     
    夸张了点
    不过上次有个英国做科学史的人说中国科学技术长期没有进步的原因是因为没有重视玻璃
    听起来很玄,我也不觉得有这么简单
    但是想想如上力学定律来自玻璃,光学和化学更不用说也来自玻璃
    玻璃在电磁学的进步上有过啥作用一时想不起了,不过<<打开原子的大门>>里面是从感应线圈
    和阴极射线管开始讲原子物理的历史,这是我小时候最喜欢的一本科普书
    这个想法还是挺有意思的
     
    另外,想到皇帝皇后们辉煌的宫殿中都只能靠不透明又脆弱的丝绸挡风
    就感觉到现代生活的美好啦
    4/17/2006

    读了一篇science上讲学生物的人工作前景的文章

    abstract一下,
    1.academy没啥前途了,新的位置非常非常有限
    2.制药业总体上是好的,但近期前途未卜
    3.制药业越来越需要交叉人才(和化学?),只会cell molecular biology不好, 不过cell culture是有用技能
    4.传统life science教育跟产业太脱节,这点和工科差的很远
    5.drug development是0-hiring major...
    6.bioinfor有需求,但是也有限,学生物的很多了解bioinfo但是程度不足以找到工作..
    7.phd的需求越来越少,bachelor的需求越来越多,很多时候公司甚至想要bachelor level below的人,master是
       鸡肋(原来master above占员工70%,现在反过来了)
    8.交流能力和合作能力非常非常重要...重要的无以复加
    9.要能说会道,好对付FDA,所以native speaker优势很大
    10.所以推荐了一些professional master's program,一边学bio一边学business school的课程
     
    结论: 似乎对学生物的,最好的去industry混的办法还是学一两年所说的communication, negotiation  and team 
              working skill然后凭本科学位去找工作....哦对了,原文中还暗示制药业的研发终将转移到中国和印度,
              所以过几年这个答案可能就是本科毕业直接在北京找工作了...